幹細胞研究と治療のジャーナル

概要

胚性幹細胞生物学におけるゲノム規模の大規模シーケンシング：最近の知見と課題

Yaofeng Wang、Alex Chun Cheung、Jun-Tao Guo、Bo Feng

哺乳類における多能性胚性幹細胞（ESC）の発見は、幹細胞研究と再生医療に大きな変化をもたらしました。多能性の分子メカニズムを理解するために、高解像度、低ノイズ、ゲノム全体にわたる広範なカバレッジなどの利点があるため、大規模なシーケンス技術が強い科学的関心を持って採用されてきました。ここでは、ChIP-Seq、RNA-Seq、methylCSeqなど、ESC研究で広く行われているゲノムワイド大規模シーケンス技術の原理をレビューします。これらの技術の最近の改良と応用についても説明します。さらに、大規模なゲノムワイドシーケンスデータを統合するために使用されるさまざまな方法の概要を示します。ESCのさまざまな側面を描写する大量のデータを統合すると、多能性を維持するための転写ネットワーク、および研究と臨床応用にとって重要なESCの遺伝子調節とエピジェネティックな変更を理解するための多くの革新が促進されます。さらに、バイオインフォマティクスと生物統計学における大規模なシーケンスデータ分析の現在の課題により、生物学者が注目する価値のある特徴を強調します。