ゲノミクスとプロテオミクスにおけるデータマイニングのジャーナル

概要

ヒトの大腸と胆嚢から分離された5つの凝固酵素陰性ブドウ球菌（CNS）のゲノムマイニングと比較ゲノム解析

ラメサン ギリシュ ナール、ガーウィンダー カウル、インドゥ カトリ、ニティン クマール シン、スディープ クマール マウリヤ、シュリクリシュナ スブラマニアン、アルナンシュ ベヘラ、ディヴィヤ ダヒヤ、ジャベド N アグレワラ、シャンムガム マイイルラージ

コアグラーゼ陰性ブドウ球菌（CNS）は、心内膜炎や尿路感染症（UTI）など、ヒトに特有の感染症を引き起こすことが知られています。驚くべきことに、特にヒト由来のCNSに対するゲノム解析データは文献に不足しています。これを考慮して、胆嚢から分離されたCNS株、Staphylococcus cohnii subsp. cohnii 株 GM22B2、Staphylococcus equorum subsp. 株 equorum G8HB1、Staphylococcus pasteuri 株 BAB3、および結腸から分離されたStaphylococcus haemolyticus 株 1HT3、Staphylococcus warneri 株 1DB1のゲノムマイニングと比較ゲノム解析を実施しました。 CNS株では、抗生物質や毒性化合物、バクテリオシンやリボソーム合成ペプチドへの耐性、接着、侵入、細胞内耐性、プロファージ領域、病原性アイランドを含む共通の毒性決定因子の29％を特定しました。接着、負の転写調節、銅やカドミウムへの耐性、ファージ成熟に関与する10の固有の毒性因子も私たちの株に存在しました。ゲノム相同性、サイズ、G + C含有量の比較とは別に、CNS株に10の異なるCRISPR-cas遺伝子が存在することも示しました。さらに、KAASベースのアノテーションにより、ヒトの疾患に関与するさまざまな経路にCNS遺伝子が存在することが明らかになりました。結論として、この研究は、2つの異なる身体器官から分離されたCNSの病原ゲノム学を明らかにする最初の試みであり、ヘルスケア分野の新興病原体としてのCNSの重要性を強調しています。