植物病理学および微生物学ジャーナル

概要

貯蔵条件下での柑橘類から分離されたペニシリア菌の遺伝的変異

アフマド・アリ・シャヒド、メーラ・アザム、モハメド・アリ、キラン・ナワズ、モアザム・アネス

パキスタンは、キノウ（マンダリン）とオレンジの世界第6位の生産国で、生産量は210万トンです。この研究では、ラホールの果物と野菜の市場を訪問し、感染した柑橘類のサンプル40個を収集し、表面を殺菌して分離のためにポテトデキストロース寒天培地に接種しました。顕微鏡検査とコロニーの特徴から、ペニシリウム属の5種（P. digitatum、P. expansum、P. biourgeianum）が特定されました。ゲノムDNAを分離し、プライマーITS 1とITS4、および真菌の5.8S rRNA遺伝子を使用して、内部転写スペーサー（ITS）を増幅しました。精製および増幅されたPCR産物は、後で配列決定され、BLASTおよびGenebankまたはNCBIソフトウェアのデータベースに対する検索によって、配列の相同性を調べました。 DNA 配列の相同性から、分離株は遺伝子データバンクの既知の DNA 配列である P. expansum、P. digitatum、および P. biourgeianum と 98% 以上の相同性を持つことがわかりました。これらの菌類分離株のうち、P. biourgieanum は感染した柑橘類から分離されたもう 1 つの新種として報告され、NCBI 遺伝子バンクのアクセッション番号 KT336317 が割り当てられました。