植物病理学および微生物学ジャーナル

概要

インドのタロイモ栽培地域における Phytophthora colocasiae の遺伝的および表現型的特徴

ヴィシュヌ スクマリ ナス、シャイニ バシール、ムトゥレクシュミ ラジャパシー ジーヴァ、シャマラ スワヤンヴァラン ヴィーナ

表現型および分子生物学的手法を用いて、5年間にわたりインドのアーンドラ・プラデーシュ州、アッサム州、ケララ州、オリッサ州から採取された40のPhytophthora colocasiae分離株を特徴づけた。毒性、コロニーの形態、交配型などの表現型パラメータは、長年にわたってさまざまな地域から採取された分離株間で異なっていた。分離株の表現型パラメータと地理的起源との間に相関は認められなかった。ランダム増幅マイクロサテライト（RAMS）分析により、分離株間で100%の多型性を伴うかなりの種内および種間変異が検出された。RAMSデータに基づき、算術平均を用いた非加重ペアグループ法（UPGMA）を使用して構築された樹形図により、P. colocasia分離株は2つの主要なクラスターにグループ化された。分離株のRAMSグループと表現型特性/地理的起源との間に関係は得られなかった。集団遺伝学的解析により、P. colocasiae分離株は地域によって非常に多様であることが示されました。分子変異解析 (AMOVA) では、P. colocasiaeの遺伝的変異のほとんどが集団内に限定されていることが示されました (93.21%)。これらの結果は、インドのP. colocasiae集団は非常に多様であり、疾病管理プログラムの開発や耐性品種の育成には注意が必要であることを示しています。