ゲノミクスとプロテオミクスにおけるデータマイニングのジャーナル

概要

宿主遺伝子の遺伝子発現レベルと遺伝子セットエンリッチメント解析

近藤洋介、宮崎暁

ゲノムワイド解析により、タンパク質コード遺伝子のイントロン領域に局在する非タンパク質コードRNA（ncRNA）があることが示されています。イントロンncRNAは、宿主遺伝子と呼ばれるタンパク質コード遺伝子のイントロンにホストされています。私たちの以前の研究では、イントロンncRNA遺伝子と宿主遺伝子のゲノム特性を報告しました。しかし、宿主遺伝子のトランスクリプトーム特性は調査されていませんでした。ここでは、宿主遺伝子の遺伝子発現レベル解析を報告し、宿主遺伝子の生物学的機能を調査します。私たちの結果は、宿主遺伝子の遺伝子発現レベルが非宿主遺伝子よりも高い傾向があることを示しました。ヒトとマウスの間でオーソログである宿主遺伝子は、非宿主オーソログ遺伝子よりも保存された発現レベルを持っています。また、発現レベルが高い宿主遺伝子は、神経系、遺伝子発現、タンパク質修飾、細胞骨格に関係していますが、発現レベルの低い宿主遺伝子にはほとんど生物学的機能がありません。これらの結果は、宿主遺伝子が特徴的な転写定量化と生物学的機能を持っていることを示唆しています。これらの特性は、宿主遺伝子発現の制御方法のさらなる解析に役立つ可能性があります。