発がんと突然変異誘発のジャーナル

概要

15q21領域の詳細なマッピングにより、濾胞性およびびまん性大細胞型B細胞リンパ腫のリンパ腫形成におけるTP53BP1とB2Mの関与が示唆される

アヤ・ボニーリャ・カルロス、カミレリ・エミリー、ベントン・マイルズ、ハウプト・ラリサ・M、マールトン・ポーラ、リー・ロッド・A、ガンジー・マーハー・K、グリフィス・リン・R

背景と目的: 濾胞性リンパ腫 (FL) とびまん性大細胞型 B 細胞リンパ腫 (DLBCL) の症例に共通する変化の発見に焦点を当てた最近の研究では、15q21 領域を標的としたヘテロ接合性喪失 (LOH) と欠失イベントが報告されており、この領域が FL と DLBCL のリンパ腫形成に関連していることが示されています。ここでは、特定された LOH とコピー喪失イベントを研究することでこの領域の遺伝子構造を調査し、FL と DLBCL のリンパ腫形成におけるこの領域を調べました。方法: FL (n=21) と DLBCL (n=21) 症例のコピー数多型 (CNV) と高解像度 LOH 解析のデータを使用して、15q15.1 と 15q21.1 遺伝子座間のゲノム領域の詳細なマッピングを実行しました。この領域の LOH の検証は、マイクロサテライトを使用して実施し、その後定量的 PCR (qPCR) を使用して TP53BP1 および B2M の転写量を測定しました。また、24 個の FL サンプルと 23 個の DLBCL サンプルの腫瘍 DNA で、B2M のエクソン 1 および 2 の直接配列決定を実施しました。結果: LOH および CNV データの統合により、7.5 Mb の領域にまたがる 15q21 遺伝子座でコピー損失の変化が特定され、LOH-1 および LOH-2 と呼ばれる 2 つの LOH 領域がカバーされました。LOH-1 領域は 3.4 Mb にまたがり、53 個の遺伝子が含まれており、その中から TP53BP1 (腫瘍タンパク質 p53 結合タンパク質 1) と B2M (ベータ 2 ミクログロブリン) が、それぞれ DNA 二本鎖切断 (DSB) 修復と免疫認識における役割から、最も可能性の高い標的遺伝子として特定されました。発現解析により、LOH を伴う NHL で TP53BP1 の顕著なアップレギュレーションが明らかになりましたが、B2M 発現には顕著な変化は見られませんでした。FL および DLBCL の B2M のエクソン 1 および 2 の直接配列決定により、DLBCL に関連する 2 つの単一対立遺伝子微小欠失が特定されました。結論: この研究により、15q21 遺伝子座にマッピングされた欠​​失が 2 つの LOH 領域をカバーすることが確認されました。TP53BP1 および B2M 遺伝子の LOH は、FL および DLBCL 腫瘍形成における一般的な変化であると思われます。