微生物および生化学技術ジャーナル

概要

微生物多様性の分析における変性勾配ゲル電気泳動の活用

シャー議員

PCR 増幅遺伝子断片のグラジエントゲル電気泳動の適用は、ヒドロゲナーゼでした。[NiFe] ヒドロゲナーゼ遺伝子配列の比較分析は、5 つの異なる PCR プライマーを使用して設計されました。これらのプライマーは、さまざまな組み合わせで、ヒドロゲナーゼを含む細菌とヒドロゲナーゼを欠く細菌のゲノム DNA でテストされました。デスルホビブリオ種に対しては、1 つのプライマー ペアのみが特異的であるように見えましたが、他の細菌では他のプライマー ペアが陽性の結果を示しました。この特定のプライマー ペアを使用することで、[NiFe] ヒドロゲナーゼ遺伝子を増幅することができました。ただし、サンプル内のデスルホビブリオの異なる種の数によってこれらの PCR 産物の DGGE 分析を設定できたのはその後でした。さまざまなバイオリアクターからの PCR 産物の DGGE 分析では、最大 2 つのラジカルが示され、微生物マット サンプルで少なくとも 5 つの識別可能なバンドが検出されました。これらのグループは、これらのサンプル内のデスルホビブリオ種の数と同じである可能性が高いため、デスルホビブリオ種の天然微生物マットの遺伝的多様性は、実験バイオリアクターよりもはるかに大きいと結論付けられます。