アグロテクノロジー

概要

単純配列反復（SSR）マーカーを用いた地上ヤム（ Dioscorea bulbifera L）の遺伝的多様性の評価

アニフィオク・ヌドゥブイシ・オスアグウ、エデムUL

Dioscorea bulbifera は、西アフリカの熱帯およびサハラ以南の地域に広く分布するヤマノイモ科の未利用作物です。国際熱帯農業研究所 (IITA) の生殖質バンクに保存されている西アフリカ産のD. bulbifera系統 25 ​​種について、96 ウェル マイクロ タイター プレート PCR 反応において、25 ul 容量反応で 10 個のマイクロサテライト遺伝子座を用いて遺伝的多様性をスクリーニングしました。反応混合物は、 10 ng/ µ l テンプレート DNA 3 µ l、 2.5 mM DNTP 2 µ l、 2.5 mM MgCl _{2 1} µ l 、フォワードプライマーとリバースプライマー各 1 µ l、DMSO 4 ₁ µ l 、5 µ g/ µ l Taq DNA ポリメラーゼ (Invitrogen) 0.1 µ l、および10 ng/ µ l DNA 3 µ l で構成されていました。総反応容量は、13.4 µl のヌクレアーゼフリー水を使用して 25 容量に調整されました。PCRプログラムは、94°C で 30 秒間の変性、続いて 94°C で 30 秒間、55 または 45°C で 20 秒間、72°C で 30 秒間を 35 サイクル、最後の伸長ステップとして 72°C で 7 分間でした。合計 74 の対立遺伝子が検出され、平均対立遺伝子数は 1 遺伝子座あたり 7.4 でした。多型情報量 (PIC) の平均値 0.74 は、系統間の変動性の存在を示しました。平均遺伝子多様性値 0.77 も観察されました。SSR アプローチは、D. bulbifera系統間の遺伝的多様性と関係の判定に有用なツールであることが判明しました。これらの結果は、この作物の保全および遺伝的改良プログラムにおいて重要です。