遺伝子テクノロジー

概要

ドロップレットデジタルPCRは、バイオマーカーFcγRIIIa-F158V遺伝子型の同定に迅速、正確、かつ費用対効果の高い方法を提供します。

ポール・グリフィス、デイビッド・サン、サラ・R・トリッチ、キャロライン・ジョケムス、ジェームズ・L・ガリー、ジェフリー・シュロム、シャオリン・ウー

新たなモノクローナル抗体、ワクチン、腫瘍溶解性ウイルス療法の開発は、成功の潜在的予測因子としてバイオマーカーの分析に依存してきました。よく研究されているバイオマーカーの 1 つは、CD16/FcγRIIIa 受容体残基 158 F/V です。FcγRIIIa 遺伝子座の遺伝子型判定による変異体の特定は広く実施されており、サンガー配列決定、フローサイトメトリー、PCR/RFLP、Goldengate (Infinium に置き換えられました)、TaqMAN 分析など、一般的に使用される方法により非常に多様です。これらの方法はそれぞれ、CD16 FcγRIIIa 158 F/V に関連する出版物でかなり裏付けられていますが、大多数は、ホモ接合体 (野生型と変異体) とヘテロ接合体を時間効率とコスト効率の高い方法で特定する上で重大な欠点があります。 FcγRIIIa-F158V 特異的プローブを使用したドロップレット デジタル PCR を利用すると、ゲノム サンプル内の配列を直接認識して正確な遺伝子型判定が可能になり、平均コストが低く、処理時間が短縮されます。ここでは、128 の患者サンプルでイルミナ シーケンシングによる確認を行い、ddPCR を使用して FcγRIIIa-F158V 遺伝子型を正確に特定する方法を示します。