微生物および生化学技術ジャーナル

概要

ポリアニリンとロドスポリジウム・トルロイデスおよび豚腎臓のD-アミノ酸酸化酵素とのドッキング - ポリアニリン支持体への固定化のための結合メカニズムの洞察

ススミタ・シンとアラック・K・ブラゴハイン

ポリアニリン (PAni) と Rhodosporidium toruloides D-アミノ酸酸化酵素 (RtDaao) およびブタ腎臓 D-aao (PkDaao) との相互作用をバイオインフォマティクス手法で研究した。PAni と RtDaao の相互作用は基質結合を妨げないため、D-アミノ酸酸化酵素 (D-aao) の活性はリガンドの影響を受けない。ブタ腎臓 D-aao (PkDaao) の活性部位空洞は、残基 Leu 51、Tyr 224、Tyr 228、Arg 283、および Gly 313 から構成される。PAni は PkDaao の鎖 G の Leu 51 および Thr 317 と、それぞれ -2.5 および -1.09 kcal/mol の相互作用エネルギーで相互作用する。D-aao はグルタルアルデヒドを架橋剤として PAni-アルギン酸ナトリウム ビーズ上に固定化した。 PAni-アルギン酸ナトリウム D-aao ビーズ 1g には、0.093 ml または 0.385 U の D-aao 酵素が含まれていました。ピルビン酸検出法で測定された活性収率 (AY) は 18.92% と計算され、ビーズの D-aao アッセイの o-PDA 法で測定された AY は 17.3% と計算されました。PAni-アルギン酸ナトリウム D-aao ビーズは、フーリエ変換赤外分光法 (FTIR)、X 線回折法 (XRD)、エネルギー分散型 X 線回折法 (EDX)、熱重量分析 (TGA)、および走査型電子顕微鏡分析によって特性評価されました。