血液疾患と輸血ジャーナル

概要

結核菌（Mtb）に対する潜在的薬剤パリタプレビルのドッキング分子解析

イヴァン・ヴィト・フェラーリ*、パオロ・パトリツィオ

結核菌（Mtb）は結核の原因物質であり、年間180万人が死亡しています。結核は一般に肺に影響を及ぼす感染症ですが、体の他の部位にも影響を及ぼす可能性があります。Mtb RNAポリメラーゼ（RNAP）は、第一選択の抗結核薬リファンピシン（Rif）の標的です。Auto dock VinaとAuto dock 4（またはMGLツール）を使用したコンピューターによるアプローチにより、PyrxとAM Dockソフトウェアで推定し、3つの異なる重要なパラメータを計算し、重篤な感染症に対する潜在的な薬剤パリタプレビルを初めて報告します。結合親和性（kcal/mol）、推定Ki（nM単位）、リガンド効率（LE、kcal/mol）タンパク質のリガンド結合部位ポケット（ID PDB 5UHB 鎖 C、DNA 指向性 RNA ポリメラーゼ サブユニット ベータ）で Pyrx（計算による創薬のための仮想スクリーニング ソフトウェア）を使用して処理された 1000 種類を超える薬剤の選択的分析の後、パリタプレビルの上記 3 つのパラメーターの値が高いことに気づき、このタイプの感染症に対する優れた候補薬剤である可能性があると結論付けました。実際、AM Dock ソフトウェアを介してラマルク遺伝的アルゴリズム (LGA) を実装した Auto dock Vina および Auto dock 4 (または Auto dock 4.2) の結果によると、2014 年に FDA によって承認されたこの経口薬は、Auto dock Vina と Auto dock Vina 4 の両方によって、優れた結合親和性値 (約 -10.00 kcal/mol)、Ki 値 40 nM、リガンド効率 約 -0.15 kcal/mol を示しています。これらの結果は、現在 TBC に対して使用されている、上記のタンパク質で結晶化された薬剤に匹敵します。