植物病理学および微生物学ジャーナル

概要

キャベツにおける Xanthomonas campestris pv. campestris の特異的検出のためのマルチプレックス PCR の開発と病気の発生との相関

RKルーヒーとSウメシャ

黒腐病は、アブラナ科、特にBrassica oleracea var. capitata（キャベツ）の最も深刻な病気で、多大な収穫量損失を引き起こします。黒腐病は種子伝染性の病気であり、種子の病原体評価は非常に重要です。キャベツの種子は、生化学分析とPCR分析によって、X. campestris pv. campestris感染について検査されました。種子サンプルは、3つのプライマーを使用してPCR分析にかけられ、そのうちhrpF遺伝子に特異的なプライマーペアの1つが黒腐病の病原体を検出できました。現在の研究は、地元で入手可能なキャベツ栽培品種を分子アッセイを使用して評価し、研究地域で広く栽培されている栽培品種の研究室と現場でのパフォーマンスの相関関係を調べた初めての研究です。この研究の目的は、キャベツ種子中のX. campestris pv. campestrisを日常的に検出するために、利用可能な特異的かつ感度の高いPCRベースの手順を使用することです。マルチプレックスPCRは、感染した種子と葉の材料における病原体とアブラナ属種、内部転写スペーサー（ITS）の同時検出のために標準化されました。マルチプレックスPCRフィンガープリントが得られ、X. campestris pv. campestrisのhrpF遺伝子の619 bp断片とアブラナ属種の内部転写スペーサー領域の360 bpセクションが増幅されました。このアッセイは、病気の植物および選択培地で分離された細菌コロニーにおけるX. campestris pv. campestris感染も容易に検出し、従来のプレーティング法よりも感度と特異性が優れていました。このように、マルチプレックスPCRを使用することで、キャベツ種子における細菌検出の閾値レベルを決定することが可能になりました。