植物病理学および微生物学ジャーナル

概要

イネにおける南部イネ黒条萎縮ウイルスの迅速な検出と定量のためのリアルタイムRT-PCR法の開発

Songbai Zhang、Deyong Zhang、Yong Liu、Xiangwen Luo、Jue Cheng、Jing Peng

南部イネ黒条萎縮ウイルス（SRBSDV）は、フィジーウイルス属グループ2の新しい病原体種であり、過去4年間（2008～2011年）に中国と東南アジアに輸入されたイネやトウモロコシなどの多くの重要な穀物作物の深刻な収量損失を引き起こしました。注目すべきことに、感染した初期のイネには典型的な症状がないため、深刻な収量損失を防ぐことができます。そのため、イネにおけるSRBSDV感染の初期段階を検出することが非常に重要です。この目的のために、リアルタイムRT-PCR法が確立され、イネサンプルでこのウイルスを検出するために使用され、従来のRT-PCRと比較されました。結果は、リアルタイム RT-PCR が SRBSDV 検出に対して高い特異性と感度を有し、Ct 値と SRBSDV コピー数の関係は 4.04×10 ² -4.04×10 ⁷コピー/反応の範囲で直線的であり、感度は 150 コピー/反応に達したことを示した。アッセイ内およびアッセイ間の変動は低かった。リアルタイム RT-PCR は圃場のイネサンプルの 87.5% - 100% で SRBSDV を検出したが、従来の RT-PCR では 63.6% - 100% であった。全体として、リアルタイム RT-PCR はイネにおける SRBSDV 検出のための価値ある代替法である。