植物病理学および微生物学ジャーナル

概要

イラン北西部の州におけるジャガイモ軟腐病の原因菌ペクトバクテリアの検出

シマ・アザドマネシュ、アリレザ・マレファト、ケイハン・アザドマネシュ

腸内細菌科に属するさまざまな細菌が、ジャガイモの黒腐病および軟腐病の原因物質として知られています。この研究では、イラン北西部のいくつかの州（ザンジャーン、コルデスタン、東アーザルバーイジャーン）の細菌を調査するために、迅速かつ特異的な検出方法が使用されました。以前の研究で代表的な病原体として特定された 26 株が研究のために選択され、それらは次のとおりでした：14 の Pectobactrium carotovorum subsp carotovorum、7 の Dickeya chrysanthemi、および 5 の Pectobactrium atrosepticum。プライマー Y1/Y2、Expccf/r、ADE1/2、および Eca1f/r は、病原体に対する特異的プライマーとして公開されています。これらをテストし、株の DNA の特異的増幅に使用できるかどうかを判断しました。多くの株で、予想された特異的フラグメントが増幅されなかったか、またはいくつかの非特異的バンドが増幅され、予想されたフラグメントに近いいくつかが増幅されました。代表的な菌株のITS領域を配列決定して病原体のDNAを増幅するための特異的プライマーを設計し、PCR検査を
開発しました。PCR検査では、各州から収集されたすべての菌株から300bpの断片が増幅されました。特異性検査では、他の属に属する細菌からはPCR産物は得られませんでした。