血液疾患と輸血ジャーナル

概要

ハイスループットSNPジェノタイピングを用いた低レベル混合キメリズムの検出

アレクセイ・ナコルチェフスキー、ユニス・フローレス、リー・シャンヤン、タオ・ホン、アンダース・ニグレン

同種骨髄移植（BMT）または幹細胞移植（SCT）のレシピエントには、拒絶反応、移植片対宿主病（GVHD）、または悪性腫瘍の再発などの移植後の副作用を早期に診断できるように臨床モニタリングが必要です。臨床現場での移植レシピエントのトリアージは、微小残存病変（MRD）をモニタリングし、末梢血リンパ球（PBL）の混合キメリズムの量を測定することによって行われます。MRDモニタリングには悪性腫瘍特異的マーカーの検出が含まれますが、混合キメリズムの程度の測定は、一般的なPCRベースの方法で行うことができます。私たちは、PBLとゲノムDNAの低レベルの混合キメリズムを検出するSNPジェノタイピング法を開発しました。感度は、92の独立したSNPマーカーのコホート全体のジェノタイピングデータの累積的な偏りを測定することによって達成されます。この方法は、10%、5%、2% の混合キメリズム サンプルに対して、感度 0.98、特異度 0.90 を示しました。この方法の全体的な特異度は 0.98、精度は 0.95 です。結果は、一連の臨床サンプルの STR データと 100% 一致しています。この方法の、すでに確立されている方法論と比較した利点は、疾患固有のマーカーを必要とせず、マルチプレックス化できることです。この方法と分析ソフトウェアは、他の遺伝子型決定および配列決定技術でも使用できます。