植物病理学および微生物学ジャーナル

概要

ループ介在等温増幅（LAMP）法を用いたアブラヤシのフザリウム萎凋病を引き起こす Fusarium oxysporum f. sp. elaeidis の検出

クワシ・アドゥセイ・フォスとマシュー・ディキンソン

油ヤシのフザリウム萎凋病を引き起こす病原菌 Fusarium oxysporum f. sp. elaeidis (FOE) は、ポリメラーゼ連鎖反応 (PCR) を使用して検出できますが、非常に時間がかかります。ループ介在等温増幅 (LAMP) 法を使用して、油ヤシの苗木で Fusarium oxysporum f. sp. elaeidis (FOE) を迅速に検出しました。研究の範囲を広げるために、症状のある油ヤシの木から収集された 8 つの追加の Fusarium oxysporum 分離株 (病原性が確認されなかったため、FOE と推定) と、症状のある成熟した油ヤシの木とトマトからそれぞれ 5 つの非 FOE 分離株が採取されました。FOE、FOE と推定、非 FOE の正体は、配列決定によって確認されました。 FOE または推定 FOE を検出するために設計された LAMP プライマーは、Secreted in Xylem (SIX8) および P-450 シトクロムの部分配列に基づいています。SIX8 および P-450 シトクロム プライマーの最も早い検出時間はそれぞれ 4 分と 6 分 45 秒で、検出の遅い時間は両方とも 26 分 30 秒でした。アニーリング導関数曲線を使用して SIX8 および P-450 シトクロムの両方の特異性のレベルを評価しましたが、LAMP プライマーのいずれも FOE、推定 FOE、および非 FOE を区別できませんでした。