植物病理学および微生物学ジャーナル

概要

逆転写ループ介在等温増幅法によるジャガイモ葉巻ウイルスの外被タンパク質遺伝子の検出

モハマド・アミン・アルマシ、ホセイン・ジャファリー、アブバクル・モラディ、ネダ・ザンド、メフディ・アガプール・オジャグカンディ、サイデ・アガイ

ループ介在等温増幅アッセイは、高い特異性と感度で DNA/RNA を増幅します。この研究では、ジャガイモ葉巻ウイルスの検出に最適化された逆転写 LAMP アッセイについて説明します。まず、DAS-ELISA アッセイを実行して、40 個の疑わしいサンプルを含むコレクションでウイルスを検出しました。最後に、2 つのサンプルが陽性サンプルとして検出されました。次に、陽性サンプルを RT-PCR 法と RT-LAMP 法で検証しました。さらに、結果は、RT-LAMP アッセイが RT-PCR と比較して 40 倍の感度と 4 倍の速さであることを示しました。RT-LAMP アッセイは、サーマルサイクラーや高度な実験室設備のないウォーターバスで実行されました。さらに、RT-LAMP 反応では、陽性サンプルはピロリン酸マグネシウムによって生成された濁度によって検出されました。興味深いことに、反応
でピロリン酸カルシウムを生成する MgSO4 の代わりに CaCl2 を使用すると、安定性と濁度の濃度の両方が大幅に向上します。したがって、MgSO4 の興味深い代替品になる可能性があります。全体として、新しく開発された RT-LAMP アッセイは、ジャガイモ葉巻ウイルスやその他のウイルス性植物病原体の早期検​​出に高感度、高特異性、低コストの手法となり得ます。