遺伝子テクノロジー

概要

哺乳類細胞DNA中の5-カルボキシルシトシンの検出

Yihua Gao、Jian Li、Bin Chen、Qingjin Yang、Junjie Zhang、Lijian Zhang、Qionglin Huang、Xiaoxia Ye、Chun Cai

5-カルボキシルシトシン（5caC）は、DNA脱メチル化経路におけるシトシン修飾の重要な誘導体である。しかし、5caCの正確な定量は、特に哺乳類組織では困難である。この苦境は、哺乳類中の5caCの微量と、既存の技術の不十分な感度に起因していると考えられる。ここでは、哺乳類細胞中の5caCを正確に定量するための新しいLC-MS/MS法を報告する。5caC標準試薬を合成し、ゲノムDNAをギ酸で加水分解し、標的化合物5caCをHILIC LC-MS/MSで検出した。結果は、5caCがマウスの臓器と癌組織に一般的に存在することを示していた。マウスの脳の5caC含有量は肺や肝臓よりも高く、結腸直腸癌組織では隣接組織と比較して明らかに減少していた。この結果は、5caCが腫瘍形成と関連し、神経機能のエピジェネティック制御において支配的な役割を果たしている可能性を示唆している。