微生物および生化学技術ジャーナル

概要

cDNAマイクロアレイによる鳥インフルエンザウイルスの検出と同定

ミシェル・N・モーガン、トラヴィス・W・ブリス、アイダ・チャン、デビッド・L・スアレス、カルビン・L・キーラー・ジュニア

既知の 16 種類の HA 亜型と 9 種類の NA 亜型すべてからなるインフルエンザ A ウイルスが鳥類から分離されました。私たちは、高度に保存されたマトリックス (M) 遺伝子、および AIV の選択されたヘマグルチニン (HA) およびノイラミニダーゼ (NA) 亜型に対応するプローブを含む診断用鳥類 cDNA マイクロアレイを作成しました。さまざまな鳥インフルエンザ分離株および亜型の HA、NA、および M 遺伝子からの cDNA RT-PCR 産物を使用して、鳥インフルエンザウイルス (AIV) cDNA マイクロアレイを作成しました。マイクロアレイは、AIV 検出および識別への適用を評価するために、AIV 分離株のパネルに対して評価されました。M 遺伝子を汎インフルエンザ マーカーとして使用し、10 個のサンプルすべてが A 型インフルエンザの株であると識別されました。アレイは、10 個のテスト サンプルのうち 7 個のサブタイプを正しく HA および NA 亜型として識別できました。これには、すべての H5 サブタイプと米国起源の 2 つの H7 サンプルの正確な識別、サブタイプ化、および地理的起源の決定が含まれます。