ゲノミクスとプロテオミクスにおけるデータマイニングのジャーナル

概要

データマイニングにより、染色体特異的 DNA プローブの新しいクラスが生成可能

H. ゼン、HUG ワイアー、J. クワン、M. ワン、B. オブライエン

間期または中期の細胞核内の染色体特異的 DNA 配列の正確な描写を可能にするプローブは、受胎産物の性別や染色体構成、胚の着床確率、および腫瘍特異的遺伝子シグネチャの定義に関する命を救う情報を提供する重要な臨床ツールとなっています。多くの場合、このような高度に特異的な DNA プローブは本質的に独自のものであり、広範なプローブ選択および最適化手順の結果です。データ マイニングと一般的なバイオインフォマティクス ツールを適用することで、コストと時間のかかるプローブ選択とテストを排除する新しいアプローチについて説明します。薬物とタンパク質の相互作用をコンピューターでモデル化する合理的な薬物設計プロセスと同様に、ここで説明する合理的なプローブ設計では、一連の基準と公開されているバイオインフォマティクス ソフトウェアを使用して、数十万のプローブ分子で構成されるライブラリから目的のプローブ分子を選択します。例では、ヒトの X 染色体と Y 染色体の DNA プローブの選択について説明します。どちらも前例のないパフォーマンスですが、同様に、このアプローチは他の染色体または種にも適用できます。