先端化学工学ジャーナル

概要

結晶構造データとモデル品質 – 0.8 Å を超える結晶構造と独立原子モデル

マウラ・マリンスカ

一般的に、電子密度の独立原子モデル (IAM) は、日常的な X 線データ分析に使用されます。ただし、このモデルでは、原子は中性で球状であると想定されているため、電子密度分布を定量的に説明できません。このプロジェクトの目的は、CuKα X 線回折データに対する電子密度の再構築のために開発された新しい方法を使用することです。これらの方法は、結合配向変形密度モデル (BODD) です。私たちの研究では、MoKα データと CuKα データに対する改良後の結果が一致することが示されました。CuKα データで観察された系統的誤差は、重原子の ADP が系統的に高く、残差密度マップとフラクタル次元プロットの密度情報が少ないことです。これは、CuKα データで利用可能な情報の量に起因します。説明した方法を使用すると、IAM 構造と比較して、より正確で精度の高い最終構造が得られることは間違いありません。予想どおり、HAR および TAAM 方法は BODD よりも正確で精度が高く、BODD はより高速でユーザーフレンドリーです。 HAR と TAAM の結果は似ていますが、HAR の改良には、SHADE サーバーの助けを借りて水素原子の ADP を推定することをお勧めします。