ファーマシューティカ アナリティカ アクタ

概要

NMRと分子動力学を用いたフェロモノトロピン神経ペプチドの立体配座研究

ディープ・バタチャリヤ、ニティン・ミシュラ、エヴァンス・C・コウチーニョ、スダ・スリヴァスタヴァ、ラグヴィル・RS・ピシュルレンカール、ムシュタク・シャイク

フェロモノトロピック神経ペプチド、Pseudaletia フェロモノトロピンは、Lys-Leu-Ser-Tyr-Asp-Asp-Lys-Val-Phe-Glu-Asn-Val-Glu-Phe-Thr-Pro-Arg-Leu の配列を持つ 18 アミノ酸ペプチドで、カイコガのメスに広く分布しています。このペプチドは、メラニン形成と赤色化ホルモン (MRCH) 活性に関与する昆虫ミオトロピック神経ペプチドであるロイコピロキニンと構造的に関連しています。NMR と分子動力学 (MD) 法を組み合わせて、溶媒として使用した水中での立体配座挙動を解明しました。構造は、1D-NMR と 2D-NMR (COSY、TOCSY、および ROESY) 実験を使用して調査されました。この立体配座は、GROMACS シミュレーション パッケージの NMR データからの距離と二面角の制約を使用した制約付き MD シミュレーションによって構築されました。ペプチドは水中では主に β シート構造をとります。