ゲノミクスとプロテオミクスにおけるデータマイニングのジャーナル

概要

ショウジョウバエにおける複製依存性ヒストン遺伝子ファミリーの協調的進化

角林直、藤田英、森川正、大橋真、松尾裕

ヒストン多重遺伝子ファミリーの進化機構を解明するため、Drosophila immigrans の複製依存性ヒストン遺伝子を解析した。H2A-H2B-H1 遺伝子を含む約 3.9 kb の領域をクローニングした。6 つの独立したクローンを配列決定し、ヌクレオチド変異について解析した。反復コピー間のこの領域の平均ヌクレオチド配列同一性は 99% 以上であり、D. immigrans のヒストン多重遺伝子ファミリーは D. melanogaster と同程度に協調して進化してきたことを示している。アミノ酸変異は低頻度で見つかった。ヒストン遺伝子の 3 番目のコドン位置の GC 含量の解析により、D. hydei および D. americana で観察された GC 含量の変化、すなわち減少は、これら 2 種の祖先が D. immigrans から分岐した後に起こったことが明らかになった。