ゲノミクスとプロテオミクスにおけるデータマイニングのジャーナル

概要

DNAメチルトランスフェラーゼの複雑性とエントロピー解析

Xiaoli Xie、Ying Yu、George Liu、Zhifa Yuan、Jiuzhou Song

背景: DNA 配列とタンパク質に関する複雑性情報の生物学的プロセスへの応用は、この研究で十分に確立されています。DNMT1 遺伝子の利用可能な配列は、情報複雑性で徹底的に調査されました。DNMT1 遺伝子は、異なる種での DNA 複製中に DNA メチル化パターンを娘鎖にコピーする役割を担う維持メチルトランスフェラーゼです。結果: 異なる種の DNMT1 遺伝子のエントロピーは DNA 塩基組成に依存し、哺乳類でのその複雑性はコーディング領域よりもイントロンで低いことがわかりました。また、DNMT1 遺伝子のドメインと非ドメインに対するエントロピーの影響も実証しました。DNA とタンパク質の配列から得られた結果は、DNA の進化が複雑性に向かう傾向があることを示しました。最も興味深いのは、ユニークなニワトリモデルにおける加齢に伴う遺伝子のメチル化の変化が、加齢によるエントロピー特性を示し、これが加齢プロセスの説明になる可能性があることです。結論: 要約すると、DNMT1 遺伝子の情報の複雑さはゲノム構成に関連しており、それによって進化と老化のプロセスと関連しているが、その本質的なメカニズムはまだ研究されていない。