コモエ・コフィ・ドナティエン・ベニエ、アジェヒ・ダディエ、デヴィッド・クリバリ・ンゴロ、ナタリー・ゲッセンド、ソランジュAKA、コフィ・マルセランDJE、ミレーユ・ドッソ
Pseudomonas aeruginosa は、食品中毒に関与している可能性があります。免疫不全または弱った人に対して病原性が高く、罹患率と死亡率が高くなります。この研究の目的は、Pseudomonas aeruginosa の分子同定に適した系統マーカーを決定することです。核酸の純度と濃度は、分光光度計で測定しました。系統マーカー (16S RNAr、recA、rpoB、STS1) を使用した感度反応と 42 株の閾値検出は、ポリメラーゼ連鎖反応 (PCR) で評価しました。230 nm での平均吸光度は 2.1 で、DNA 抽出物の平均比率 (A260/A280) は 1.7 です。 Pseudomonas aeruginosa 参照株 ATCC 27853 の閾値検出は、rpoB では 0.8 μg/ml、16S マーカー RNAr および recA ではそれぞれ 7.6 μg/ml でした。陽性対照株 CP2: 1125A および CP3: API の閾値検出は、rpoB 遺伝子を使用する場合、それぞれ 1.2 μg/ml および 0.1 μg/ml でした。この閾値は、recA 遺伝子の場合、それぞれ 12.3 μg/ml および 0.9 μg/ml でした。rpoB ハウスキーピング遺伝子の感度は 97.4% で、次いで recA および 16S RNAr がそれぞれ 87.2% および 82.1% でした。rpoB 遺伝子の系統発生分解能は、16S rRNA および recA 遺伝子よりも高かったです。ITS1 マーカーでは感受性反応は観察されませんでした。核酸の品質、純度、系統マーカーの選択は、PCR 分析にとって最も重要な要素の 1 つです。