微生物および生化学技術ジャーナル

概要

排水処理場の活性汚泥におけるアンモニア酸化細菌の分子遺伝学的解析

MP シャー

我々は、ポリメラーゼ連鎖反応（PCR）、それに続く末端制限酵素断片長多型（T-RFLP）、クローニング、およびアンモニアモノオキシゲナーゼ遺伝子のαサブユニット（amoA）の配列決定を用いて、活性汚泥中のアンモニア酸化細菌（AOB）の群集を調査した。本研究では、PCRによるアンモニア酸化細菌16S rDNA断片の特異的増幅、変性勾配ゲル電気泳動（DGGE）による混合PCRサンプルの分離、およびオリゴヌクレオチドプローブによる特異的ハイブリダイゼーションによるバンド同定の技術を組み合わせ、複数のサンプルの群集構成を空間および時間にわたって比較できるようにした。また、対象のDGGEバンドを切り出し、DNAの単離、再増幅、配列決定、系統解析を行った。我々は、出現した大型水草 Glyceria maxima の月間サンプルを比較し、植物の根と酸素の利用可能性が、存在する β サブグループのアンモニア酸化菌の個体群に及ぼす可能性のある季節的影響を判定しました。同様に、異なる場所から採取した、酸素の利用可能性が異なる 5 つの土壌または堆積物のサンプルを比較しました。検査したサンプルでは、​​以前に定義された 2 つの Nitrosospira シーケンス クラスターの存在が区別して検出されましたが、定期的に無酸素になる環境に特有の特定のグループに関する証拠はありませんでした。