植物病理学および微生物学ジャーナル

概要

チュニジアのさまざまなトマト栽培地から回収されたトマト関連根圏細菌の特性

ナダ・オハイビ＝ベン・アブデルジャリル、ジェシカ・ヴァランス、ジョナサン・ガーボア、エミリー・ブルーズ、ギリェルメ・マルティンス、パトリス・レイ、メイダ・ダーミ＝レマディ

本研究では、土壌伝染病、主に根腐れや根腐れの深刻な病害が発生した畑で育った健康なトマトの根圏から、合計 200 の根圏細菌分離株を採取しました。試験管内での Sclerotinia sclerotiorum および Rhizoctonia solani の増殖を抑制する能力をスクリーニングしたところ、試験した 200 のうち 69 および 57 の分離株が、対照群と比較して標的病原体の菌糸の成長を 11～62% 大幅に抑制できることが示されました。対照群と比較して 45% 以上両方の菌類の増殖を抑制する最も効果的な 25 の分離株が選択され、形態学的、生化学的、分子的および代謝的特性評価が行われました。このトマト関連根圏細菌のコレクションは、形態学的および生化学的に非常に多様性に富んでいます。 16S rRNA および rpoB 遺伝子の配列決定により、バチルス属、クリセオバクテリウム属、エンテロバクター属、クレブシエラ属の 4 つの属が特定されました。最も頻度の高い種は、B. amyloliquefaciens、B. thuringiensis、B. megaterium、B. subtilis、E. cloacae、C. jejuense、K. pneumoniae でした。植物成長促進特性をスクリーニングした結果、20 の分離株がシデロフォアを生成できること、18 が可溶性リン酸を有すること、19 がインドール-3-酢酸 (IAA) を合成できることが示されました。リポペプチド生合成遺伝子の PCR 増幅により、18 の分離株と 16 の分離株で、それぞれフェンギシン A とバシロマイシン D の生合成をコードする遺伝子が存在することが明らかになりました。 Biolog™ Ecoplates を使用して行われた代謝特性評価では、トマト関連の根圏細菌は大きな代謝活性を示し、培養期間が長くなるにつれて幅広い炭素源を利用できることが示されました。代謝プロファイルに基づいて、これらの根圏細菌分離株は、異なるサンプリング時間 (培養 24、48、120 時間) で生成された 8 つの主要なクラスターに分類されました。平均ウェルカラー発達 (AWCD) 値は、シャノン多様性指数と正の相関関係にあることがわかりました。