水産養殖研究開発ジャーナル

概要

太平洋シロエビ養殖池における原核生物および真核生物微生物群集の特性評価

Dongwei Hou、Shenzheng Zeng、Jian Liu、Muting Yan、Shaoping Weng、Jianguo He Jianguo、Zhijian Huang

この研究では、5 つの異なる太平洋白エビ養殖池の水 30 サンプルにおける原核微生物と真核微生物の群集構成と優勢な分類をプロファイルしています。16S rRNA 遺伝子と 18S rRNA 遺伝子の V4 領域は、ハイスループット シーケンシング技術によって配列決定されました。分類のために、3,841 の原核生物操作分類単位 (OTU) と 990 の真核生物 OTU を含む、合計 1,387,317 の 16S rRNA と 1,612,056 の 18S rRNA 遺伝子断片が選択されました。すべての 16S rRNA 配列は少なくとも 47 の細菌部門に、18S rRNA 配列は 50 の真核生物部門にそれぞれ関連していることが観察されました。 30 個のサンプルすべてにおいて、門レベルで優勢な原核生物と真核生物のコミュニティは、構成においてかなりの類似性を共有していましたが、豊富さにおいてではありませんでした。優勢な原核生物コミュニティには、放線菌、プロテオバクテリア、シアノバクテリア、プランクトミセス、ウェルコミクロビア、バクテロイデス、緑藻類、緑藻綱、フィルミクテス綱、スピロヘータが含まれていました。真核生物では、ケルコゾア、緑藻綱、節足動物、ストラメノパイルス（未確認）、菌類（未確認）、プリムネシオフィセア、繊毛虫、軟体動物、チョアノモナダ、ヤコビダが優勢な構成でした。同様に、30 個のサンプル間で属レベルで有意な違いがありました。豊富さと多様性の結果は、5 つの池で原核微生物と真核微生物が複雑なコミュニティ構成を持っていることを示しまし た。異なる期間と異なる池では、Chao、Ace、Shannon、Simpson 指数の値に有意差はありませんでした (P >0.05)。