植物病理学および微生物学ジャーナル

概要

トマトの細菌性萎凋病を引き起こすインド産Ralstonia solanacearum Biovars 3 および 4株の生物学的特徴と遺伝的多様性

ディネシュ・シン、シュエタ・シンハ、ガリマ・チョーダリー、ヤダブ・DK

トマト（Solanum lycopersicum L.）の細菌性萎凋病を引き起こす Ralstonia solanacearum 生物型 3 および 4 は、世界中で壊滅的な土壌伝染性植物病原体です。インドのジャンムー・カシミール州、ヒマーチャル・プラデーシュ州、ウッタラーカンド州、ジャールカンド州、オリッサ州の萎凋したトマトの木から Ralstonia solanacearum の分離株 87 株が分離され、伝統的および分子生物学的手法によって特徴付けられました。一連の炭素源を使用して R. solanacearum の生物型を決定したところ、R. solanacearum の生物型 3 がインドのすべての州で最も多く（90.2 パーセント）見られ、一方、生物型 4 はジャールカンド州とヒマーチャル・プラデーシュ州で見られました。系統型特異的マルチプレックスPCRにより、トマトに感染するR. solanacearumの87分離株すべてが系統型Iに分類されました。遺伝的多様性を研究するために、BOX-PCRと多座配列タイピング法が使用されました。増幅産物は500 bp～4 kbの範囲のBOX-PCRフィンガープリントパターンで得られ、50%の類似係数でR. solanacearumの87分離株の23のDNAタイピンググループが見つかりました。多座配列タイピングでは、異なる農業気候帯に属するR. solanacearumの18株の3つの毒性遺伝子、すなわちhrp（転写調節）とegl（エンドグルカナーゼ前駆体）およびfli C遺伝子が行われました。 egl 遺伝子の配列分析に基づくと、ORT-8、UTT-23、JHT2 を除く R. solanacearum のインド株の大部分は互いに非常に近似しており、GMI1000 株にも非常に近似していました。分離場所や気候条件に関係なく、R. solanacearum のインド分離株には多くの遺伝的変異が見られました。