ゲノミクスとプロテオミクスにおけるデータマイニングのジャーナル

概要

ウイルスメタゲノミクスのためのバイオインフォマティクス

ダビット・ブジャラヴァとヨアキム・ディルナー

生体試料中の既知および未知のウイルスの存在の検出は、今日ではウイルス メタゲノミクスを使用して日常的に行われています。HiSeq (Illumina)、454 GS FLX (Roche)、SOLiD (ABI)、Ion Torrent Proton (Life Technologies) などの新しい次世代シーケンシング技術により、塩基あたりのシーケンシング速度とコストが急速に低下しているため、バイオインフォマティクス分析は現在、ウイルス メタゲノミクス分析で最も重要かつ要求の厳しい部分となっています。このレビューでは、ウイルス メタゲノミクスの主な課題と、最も一般的に採用されているバイオインフォマティクス ツールのいくつかを紹介します。