薬理ゲノミクスと薬理プロテオミクスのジャーナル

概要

SNP と CNV を超えて: 多型タンデムリピートの薬理ゲノム学

エフゲニー・クリネツキー

多型性短鎖反復配列 (STR) は、遺伝子変異の別のクラスとして出現し、一塩基多型 (SNP) およびコピー数多型 (CNV) とともに、薬物療法に対する反応の変動性を説明できます。STR は、ヒトゲノムに広く存在し、遺伝子発現の調節因子としての機能的役割が推定されるため、薬理ゲノム研究で関心を集めています。検索アルゴリズムによって異なりますが、ヒト参照ゲノムには 2～6 bp 長のモチーフを持つ STR 遺伝子座が約 700,000～1,000,000 個あります。STR は、非翻訳領域 (UTR)、タンパク質コード配列、およびイントロンにランダムに分布しており、ヒト遺伝子のプロモーター領域で過剰に存在します。STR の機能的役割は、遺伝子発現、スプライシング、タンパク質配列への影響、および病原性効果との関連によって実証されています。 STR の本質的な特性は、反復単位数の拡大または縮小による突然変異率が高いことです。STR の長さの変化は遺伝子発現の調節に重要な役割を果たしており、STR は複数の遺伝子の発現を弱める一般的な調節要素であると考えられます。遺伝子発現に対する STR の影響を解明することで、薬物反応の変動を部分的に説明できる可能性がありますが、これは SNP または CNV のみに分析を集中するだけでは達成できません。このレビューでは、薬物療法への反応を含む臨床症状における多型 STR の役割をまとめています。