ゲノミクスとプロテオミクスにおけるデータマイニングのジャーナル

概要

rpoBおよびkatG遺伝子のコドンの解析と変異、および RNA β ポリメラーゼサブユニットによる RIF 結合モデルのバイオインフォマティクス研究: メラウケ総合病院 (インドネシア) の結核患者を対象とした研究

カウルルHSIとンギリY

結核患者の治療は、通常、リファンピシン（RIF）とイソニアジド（INH）を主な選択肢とする3種類の抗結核薬を投与し、その後ストレプトマイシンまたはピラジナミドを併用して行われます。RIF耐性は、RNAポリメラーゼβサブユニットを生成する遺伝子であるrpoB遺伝子の変異に起因し、INH耐性は主にkatG遺伝子の変異に起因します。本研究の目的は、MDR-TBと関連遺伝子との関連性に関する情報、およびメラウケの結核患者における結核菌の遺伝子型の組み合わせに関する情報を得ることです。ここでは、ほとんどの MDRTB 分離株が他の抗結核薬に耐性があり、rpoB526 と rpoB531 (両側に発生する変異/この場所はほぼ常に一緒に発生する) の変異頻度はほぼ同じであるが、katG315 変異は 16 分離株にのみ存在する (katG315 で発生する変異の数は rpoB526 と rpoB531 よりも少ない) ことを報告しました。6 つの抗結核薬に感受性のある Mycobacterium tuberculosis で C1363A ヌクレオチド変化が存在することから、すべての rpoB 変異が耐性を引き起こすわけではないことがわかりました。この現象に基づいて、MDR-TB 株の形成メカニズムは rpoB 変異から始まり、その後に katG の変異が続くと提案できます。この研究は、rpoB に作用するリファンピシンなど、1 つの遺伝子のみに作用する薬剤に対する耐性のメカニズムは、katG 以外の他の遺伝子に作用するイソニアジドなど、複数の遺伝子に作用する抗結核薬よりも制御しやすいことを示しています。