ゲノミクスとプロテオミクスにおけるデータマイニングのジャーナル

概要

野兎病のエージェントベースモデル

オリバー・アティとサイモン・デフラー

野兎病菌は恐ろしい細胞内病原体です。吸入すると、死亡率の高い全身性疾患（野兎病）を引き起こします。私たちは、このクラスの感染症の計算ツールの開発を目指しました。野兎病菌は、感染の結果を決定する可能性のあるパラメータを推測するための広範なデータセットが利用できない、生物学的脅威の微生物です。私たちは、吸入野兎病とそれに続く肝臓への播種をシミュレートし、実験データと検証済みの宿主防御機構の一般的なパラメータを組み込んだ、2コンパートメントエージェントベースのモデルを提示します。このシステムアプローチは、マクロファージの初期数、播種の可能性、細菌の初期排除率が、野兎病菌による感染の結果と相関していることを示唆しています。これらの発見は、野兎病の予防における初期の自然免疫防御機構の重要性を強調しています。