植物病理学および微生物学ジャーナル

概要

黒コショウの根腐れ病の原因菌である Phytophthora capsici からのエリシチン遺伝子の全長の増幅、クローニング、およびシミュレーションによる予測

Vijesh Kumar IP、Reena N、Anandaraj M、Eapen SJ、Johnson GK、Vinitha KB

エリシチンは、感染した植物の葉の壊死を引き起こす、フィトフトラによって分泌される小さなタンパク質のファミリーです。ここでは、広範囲の宿主植物に重大な損傷を引き起こす卵菌類の植物病原体である P. capsici からのエリシチン遺伝子のクローニングを報告します。エリシチン配列は、保存されたモチーフに基づいて他のフィトフトラ生物の既知のエリシチン遺伝子から設計されたプライマーを使用して増幅されました。PCR 増幅産物のサイズは 256 bp 長であり、配列決定された産物の BLAST 分析は、P. capsici のアルファエリシチン配列と完全に一致しました。続いて、増幅産物をゲノムに対してクエリすることにより、P. capsici のゲノム配列情報からエリシチンの完全な遺伝子を特徴付ける試みがなされました。完全なゲノムに対するローカル BLAST 検索により、完全なコード配列が特定されました。さらに配列解析を行った結果、プロモーター配列、転写開始部位、リーダーシグナル配列、コアエリシチンドメイン、および保存された6つのシステイン残基が特定されました。さらに、カプシセインの3次元構造がモデル化され、分子ドッキングを使用してステロールとカプシセインの結合親和性が研究されました。開発されたモデルは、Tyr 47に対する強い結合親和性を予測しました。