植物病理学および微生物学ジャーナル

概要

Rhizoctonia solani と Waitea circinata の種内グループの同定のための AFLP フィンガープリンティング

ビマル・S・アマラダサ、ディリップ・ラクシュマン、キーナン・アムンセン

Thanatephorus cucumeris (Frank) Donk および Waitea circinata Warcup および Talbot 変種 (アナモルフ: Rhizoctonia 属種) によって引き起こされる斑点病は、いくつかの重要な芝草種の正常な維持管理にとって深刻な脅威となります。Rhizoctonia の原因物質を特定するために圃場の症状に頼るのは困難で誤解を招く可能性があります。異なる Rhizoctonia 属種および Anastomosis Group (AG) は、一般的に使用される殺菌剤に対する感受性が異なり、病気を引き起こすのに適した温度範囲も異なります。したがって、病気の進行を予測し、将来の病気の管理を決定するには、原因となる病原体を正しく特定することが重要です。Rhizoctonia 属種を anastomosis 反応でグループ化するのは難しく、時間がかかります。内部転写スペーサー (ITS) 領域の配列決定による Rhizoctonia 分離株の特定は、コストがかかりすぎる可能性があります。一部の Rhizoctonia分離株は、ITS 領域の多型性のために配列決定が困難です。増幅断片長多型（AFLP）は、多くの生物の遺伝的多様性を調査するための信頼性が高く費用対効果の高いフィンガープリンティング法です。AFLP が Rhizoctonia 分離株の種内レベルを推測するのに適切であるかどうかを判断するための詳細な分析は行われていません。本研究の目的は、未知の R. solani Kühn および W. circinata 分離株の種内レベルを識別するための AFLP フィンガープリンティングを開発することです。以前に特徴付けられた 79 の R. solani（n=55）および W. circinata（n=24）分離株が、4 つのプライマーペアによって生成された AFLP マーカーで分析されました。算術平均による加重ペアグループ法（UPGMA）は、AG、AG サブグループ、または W.circinata 変種に従って、R. solani および W.circinata 分離株を正しくグループ化しました。主成分分析（PCA）は UPGMA クラスターを裏付けました。私たちの知る限り、AFLP 分析が、広範囲の Rhizoctonia 分離株にわたって AG、AG サブグループ、または W.circinata 変種を解読する方法としてテストされたのはこれが初めてです。