単細胞生物学

概要

高解像度融解（HRM）分析による魚類の蠕虫の分離と識別のための強調分子検出技術

ニーシュマ・ジャイスワル、ラシュミ・トリパティ、サンディープ・K・マルホトラ

リアルタイムPCRと高解像度分子（HRM）分析を組み合わせて、核リボソームDNAの2番目の内部転写スペーサー（ITS-2）をターゲットにしました。後者は、海水魚と淡水魚に寄生する2種のアニサキス科と1種のククラニド科を識別および区別するための遺伝子マーカーとして機能しました。調査した3種の線虫のそれぞれについて、HRMパターンのユニークで異なる特徴が生成されました。Anisakis simplex（Rudolphi）、Contrcaecum osculatum（Rudolphi）Dujardin、Contrcaecum sp.、およびDacnitoides cotylophora（Ward and Magath）の増幅が開始される融解プロファイルとサイクルの閾値（Ct値）は、種を診断するものでした。Dacnitoides、Anisakis、およびContrcaecumアッセイのリボソームDNAの内部転写スペーサー（ITS）の配列決定と比較による分子分析により、Dacnitoides、Anisakis、およびContrcaecumの明確な同一性が確立されました。本研究では、分子系統学的および形態分子学的分析を展開し、ククラニド線虫およびアニサキス線虫の診断成分を特徴づけます。