細菌学および寄生虫学ジャーナル

概要

機能的相互作用ネットワーク分析に基づく結核菌、らい菌、スメグマ菌のシステムレベルの比較

リチャード・O・アキノラ、ガストン・K・マザンドゥ、ニコラ・J・モルダー

らい菌は、主に皮膚、末梢神経、眼、上気道粘膜に影響を及ぼすハンセン病を引き起こす病原菌です。この数年間、多剤併用療法 (MDT) 戦略によってこの病気を阻止する大きな進歩が記録されていますが、毎年、この病気の新たな症例が報告されています。世界保健機関によると、2011 年の初めには 192,242 件の新規症例がありました。らい菌は実験室で培養することはできませんが、ハンセン病にかかりやすいため、マウスの足裏で培養でき、最近ではナミブカゲアルマジロで培養できます。そのゲノムは大幅に縮小されているため、結核菌 (MTB) と同じ祖先を持つ、マイコバクテリア属内の縮小進化のモデルとして興味深い種です。 MTB の機能ネットワークは以前に生成されており、ネットワークのトポロジー特性に基づいて生物の生物学的組織を明らかにするために、広範な計算分析が行われました。ここでは、公開データベースのゲノム配列と機能データを使用して、別の成長が遅い Mycobacterium leprae (MLP) と成長が速い非病原性 Mycobacterium smegmatis (MSM) のタンパク質機能ネットワークを構築します。MTB ネットワークと組み合わせることで、ゲノムサイズの異なる 3 つの結核菌を比較する機会が生まれます。この論文では、ネットワーク中心性尺度を使用して MTB、MLP、および MSM を体系的に比較し、システム生物学レベルでこれらの生物の違いを定量化し、ネットワーク生物学と進化を研究します。