シファマンドラ・ラムラ
アフリカ、特にサハラ以南のアフリカにおける穀物農業は、非生物的ストレス(干ばつや不適切な作物管理技術など)と生物的ストレス(真菌性病害虫)の複合的な影響に直面しています。これらのうち、穀類シスト線虫(CCN)(Heterodera spp.)、ネコブセンチュウ(RKN)(Meloidogyne spp.)、および根損傷線虫(RLN)(Pratylenchus spp.)は、穀物生産の主な制限要因であり、世界中の小麦にとって経済的に重要であり、フザリウム属などの真菌感染の主な促進因子であると考えられています。植物寄生性線虫(PPN)による穀物の損失は、世界中で最大6.9~50%(1,250億米ドル)と推定されています。これらのPPNによる被害、その行動、および防除は、他の国々では穀物の生産性が著しく低下する可能性があることが指摘されているにもかかわらず、多くのアフリカ諸国、特にサハラ以南のアフリカ諸国ではほとんど注目されていません。現在の研究は、南アフリカの小麦生産地域における植物寄生性線虫群集を特定することを目的としており、形態学的および分子学的同定に重点を置いています。合計776の複合根圏土壌および根サンプルが、フリーステイト州(4)、クワズール・ナタール州(1)、北ケープ州(6)、西ケープ州(13)の2シーズンにわたって24の地域から収集されました。適応したデカンテーションおよびふるい分け法、続いて適応した糖遠心分離法を使用して、土壌および根サンプルから線虫を抽出しました。サンプルを24時間水に浸し、抽出物を20μmのふるいにかけることで、穀粒から線虫を抽出しました。線虫の種は形態測定学と形態学的特徴に基づいて特定され、各属または科の顕著性値 (PV) が計算されました。次の属/科/目の個体が次の州から特定されました: フリーステイト: Pratylenchus、Rotylenchus、Scutellonema、Helicotylenchus、Criconema、および Dolichodorus。クワズール・ナタール: Meloidogyne、Pratylenchus、Criconema、Spiral、および Longidorus。北ケープ州: Pratylenchus、Criconema、および Spiral。西ケープ州: Pratylenchus、Rotylenchus、Scutellonema、Helicotylenchus、Coslenchus、Tylenchus、および Xiphinema。 PV 値によると、現在までに各地で特定されている主な属は、Pratylenchus、Meloidogyne、Spiral、Coslenchus、Tylenchus、Criconema、Longidorus、および Xiphinema です。クワズール・ナタール州の Cedara では、他のサンプル採取地域と比較して Meloidogyne の数が多く (土壌 200 g あたり 2 期幼虫 420 匹) 見られました。西ケープ州 (マルムズベリー) では、Pratylenchus sp. の数が多く (土壌 200 g あたり 8750 匹) 見られました。根のサンプルでは、Cedara の Meloidogyne の PV は 183 で、Pratylenchus sp. では De Vlei (PV=943)、Tygerhoek (PV=490)、Kopporfontein (PV=134)、Wellington (PV=57) がこれに続きました。穀粒サンプルでは植物寄生性線虫は見つかりませんでした。しかし、フリーステート州のクラレンス産の小麦の穀粒から細菌食性のパナグロライムス属の種が特定された。これは南アフリカおよび世界初の記録です。検出された属の増幅のための D2-D3、18S rRNA、ITS、PCR、および SCAR-PCR が進行中であり、これまでに、経済的に重要な種の中でも、Pratylenchus thornei、Pratylenchus neglectus、Pratylenchus Bolivian などの種が増幅され、そのデータは形態学的および形態計測学的同定と一致しています。線虫害虫は、その顕微鏡的サイズのため、見落とされたり、誤診されたりすることがよくあります。