ゲノミクスとプロテオミクスにおけるデータマイニングのジャーナル

概要

言語と認知遺伝子の一般的な進化の展望

Zhizhou Zhang、Shuaiyu Zhang、Hongjie Zhou、Yongdong Xu

言語遺伝子 (LG) の多型プロファイルは、古代および現代のさまざまな集団で異なるパターンを示しているため、認知遺伝子 (CG) の多型プロファイルは同様の傾向を示している可能性があると推測されます。ただし、言語遺伝子多型パターン (LGPP) と認知遺伝子多型パターン (CGPP) の進化プロセスは、異なる特性を示す可能性があります。特に、進化の大きな時間スケールで CGPP と LGPP の重要な変化のタイミングに重複があるかどうかを判断することは興味深いことです。このような重複の可能性は、LGPP と CGPP に重要な変化があるサンプルが同じかどうかを調べることによっても評価できます。この研究では、170 の全ゲノムにわたって 18 の言語遺伝子 (LG) の 239 の一塩基多型 (SNP) 座と 18 の認知遺伝子 (CG) の 223 の SNP 座における遺伝的差異を調査しました。主成分分析（PCA）を使用して、上記サンプルのSNPデータをクラスタリングし、各サンプル間のSNPパターンの類似性をLG、CG、認知遺伝子言語遺伝子（CGLG）の3つの観点から計算しました。基本的な結論は次のとおりです。（1）PCA分析結果の異なる位置が本質的にSNP多型のパターンの違いを表すことができる場合、言語遺伝子多型パターンと認知遺伝子多型パターンはどちらも異なる進化段階を経ています。（2）人類の進化の過程で、言語遺伝子多型パターンと認知遺伝子多型パターンの初期の発現には大きな違いがありました。言語遺伝子多型パターンは、進化の初期段階では一般的な動物、霊長類、古代人のサンプルを区別できませんでしたが、認知遺伝子多型パターンは当初、動物のグループと特定の古代人のサンプルによく似たパターンと、別の動物と霊長類のサンプルセットに反映されたパターンの2つのパターンに分けられるように見えました。 (3) 5大陸すべてのサンプルは進化のあらゆる段階で観察できるようで、これは進化する新しい集団が常に大陸を越えて広がる十分な時間があったことを示唆している。(4) 170サンプルのSNPプロファイルを定量的に比較したところ、CGとLGプラスCGLGプロファイルには確かに2～3の潜在的な重要な変化点があり、これらの重要な変化点を持つサンプルにはge1（ジョージア）とus2（北米）という2つの共通サンプルがあり、これは人類の進化の間に言語や認知の遺伝子多型パターンに起こった最も重要な変化がヨーロッパ/北米の一部の人類集団で起こった可能性があることを示唆している。