概要

16S-23S 遺伝子間スペーサー (ITS) 領域配列解析: 非溶血性連鎖球菌に類似する属および種の同定における適用性と有用性

Xiaohui Chen Nielsen、Derya Carkaci、Rimtas Dargis、Lise Hannecke、Ulrik Stenz Justesen、Michael Kemp、Jens Jørgen Christensen、Monja Hammer

カタラーゼ陰性、グラム陽性球菌で、連鎖球菌や腸球菌に属さない種は、分子分類研究に基づいて、ますますよく特徴付けられるようになり、分類上の実体の数は着実に増加しています。これにより、それらの同定が複雑になっています。16S-23S インタージェニック スペーサー (ITS) 領域配列解析は、連鎖球菌属と腸球菌属の種の同定に有用なツールであることが証明されています。本研究では、Aerococcus、Abiotrophia、Alloiococcus、Dolosicoccus、Dolosigranulum、Facklamia、Granulicatella、Gemella、Ignavigranum、Leuconostoc、および Vagococcus 属内の種の同定に共通するツールとして ITS 配列解析を使用する可能性を調査しました。29 の標準株と 103 の特徴が明らかになっている臨床株の ITS 配列を決定し、種の同定のために BLAST 解析を実行しました。すべての臨床株は、種レベルで確実に同定されました。系統解析では、割り当てられた種とそれぞれのタイプ株との株の明確なクラスター化が示されました。したがって、ITS 配列解析は、カタラーゼ陰性でグラム陽性球菌の属に属する細菌の種の同定に役立ちました。潜在的に、ITS は、非溶血性連鎖球菌、腸球菌、および本研究で調査された分類群を含むカタラーゼ陰性でグラム陽性の球菌のグループの第一線同定ツールと見なすことができます。

免責事項: この要約は人工知能ツールを使用して翻訳されており、まだレビューまたは確認されていません